授業の目標

本講義では、生命工学一般への計算機科学の応用について、基礎となる概念、手法を講義するとともに、実際にコンピューターを用いた実習を通じて理解を深める。

授業の概要

遺伝子工学に対するコンピューターの応用として、遺伝子配列解析の手法について解説する。さらにデータベースに蓄積された配列情報に対するホモロジー解析、それを利用した生体分子の構造予測と機能解析、およびゲノム解析に関して解説する。次に蛋白質工学に対する応用として、構造データベースの利用、および分子グラフィックスについて解説する。各々の解説の後、コンピューターを用いた実習を行う。

具体的な講義内容

1. 生物情報工学概論
2. 文献・特許データベース
3. 遺伝子データベース
4. 遺伝子解析のためのツール
5. ゲノムデータベース
6. 遺伝子の探索と遺伝子の機能予測
7. DNA配列の中から遺伝子を探す
8. アラインメントと系統樹作成
9. 遺伝子解析ソフトの使い方
10. システムバイオロジー入門:KEGGの使い方
11. 立体構造のグラフィックス表示ソフトの使い方
12. 立体構造データベースの利用
13. 蛋白質の構造と機能 (DNA結合蛋白質を中心として)
14. 蛋白質の構造と機能 (酵素の構造と機能について)
15. まとめ

教科書

なし

参考書

バイオデータベースとウェブツールの手取り足取り活用法 (羊土社)

関連性のある科目

遺伝子工学、分子生物学1、分子生物学2、生物反応工学、生命物理科学1,2

履修条件

サテライトラボでPCを使用するので、IDとパスワードを用意しておくこと。

成績評価

• 出席，レポート等の平常点 (100%)で総合的に評価する。
• 履修取り下げ制度を採用する。
• 授業を4回欠席した場合には「欠席」と判定する。